药物治疗可较快地控制病人的症状，消除炎症，缓解病情，使病人能更好地进行运动锻炼，但药物治疗可能会给病人带来各种不良反应，有可能还有副作用。因此病人应了解自己所服药物的作用和可能发生的副作用。目前常用的治疗强直性脊柱炎的药物有非团体类消炎镇痛药物，慢性作用药物及糖皮质激素。
(一)非甾体类消炎镇痛药物
这类药物起效较快，能在较短时间内控制疼痛，是应用最广泛的药物。常用的品种有双氮酚酸钠、舒林酸、布洛芬等，它们常见的副作用为消化道不良反应。有消化道溃疡及出血史的病人应慎用这些药物，必要时合用胃粘膜保护剂。最近上市的有选择性的环氧化酶II抑制剂莫比可、怕美力对消化道的安全性相比较高。
(二)慢性作用药物
常用的有柳氮磺胺吡啶、甲氨喋呤等。这类药物起效较慢，需用药3个月左右才发生作用，所以称之为慢性作用药物。应用这些药物治疗强直性脊柱炎，有可能减缓或阻止病情的发展。这些药物的副作用也较多，除了消化道反应外，还可引起白细胞减少、皮疹等，应在医生的指导下使用这类药物，对磺胺药过敏者，禁用柳氮磺胺吡啶。
(三)糖皮质激素糖皮质激素作为治疗强直性脊柱炎的一类药物具有很强的消炎、镇痛作用，但由于其不能控制强直性脊柱炎的病情发展，且有较多的副作用，应不作为治疗强直性脊柱炎的首选药物。应在医生的建议下适当应用之。
